عیسی کلانتری، رئیس سازمان محیط زیست ایران، اعلام کرده است که دلیل تعطیلی مدارس طبیعت «مخالفت مراجع تقلید و وزارت اطلاعات» بوده است. اردیبهشت سال ۹۲، اولین مدرسه سبز در شهرستان شهریار افتتاح شده بود و اعلام شد این نوع مدرسه‌ها بعدها در کشور بیشتر خواهند شد.