هیئت دولت جمهوری اسلامی با صدور اطلاعیه‌ای ترور مسعود علی‌محمدی، استاد فیزیک دانشگاه تهران را محکوم کرد و از دستور محمود احمدی نژاد به دستگاه‌های اطلاعاتی و امنیتی برای شناسایی و بازداشت عوامل آن خبر داد.
رامین مهمان‌پرست، سخنگوی وزارت خارجه، دكتر علی‌محمدی را «اندیشمند هسته‌‌ای» معرفی کرد و ترور او را به «عوامل صهیونیستی و مزدوران آمریكا» نسبت داد، ادعایی که خبرگزاری‌های دولتی و بخش‌های خبری صدا و سیما جمهوری اسلامی نیز آن را تکرار کردند.
با این همه، علی شیرزادیان سخنگو و مدیرکل روابط عمومی سازمان انرژی اتمی شایعات مربوط به رابطه استخدامی دکتر علی‌محمدی با آن سازمان را قویاً تکذیب کرد. گروهی از دانشجویان دانشکده فیزیک دانشگاه تهران هم، با انتشار بیانیه‌ای ضمن اشاره به جهت‌گیری‌های سیاسی اصلاح‌طلبانه‌ی دکتر علی‌محمدی، وی را فردی که «مشوق دانشجویان برای شرکت در راهپیمایی سکوت اعتراض‌آمیز به نتایج انتخابات بود»، معرفی کردند.
رامین مهمان‌پرست، سخنگوی وزارت خارجه، دكتر علی‌محمدی را «اندیشمند هسته‌‌ای» معرفی کرد و ترور او را به «عوامل صهیونیستی و مزدوران آمریكا» نسبت داد، ادعایی که خبرگزاری‌های دولتی و بخش‌های خبری صدا و سیما جمهوری اسلامی نیز آن را تکرار کردند.
با این همه، علی شیرزادیان سخنگو و مدیرکل روابط عمومی سازمان انرژی اتمی شایعات مربوط به رابطه استخدامی دکتر علی‌محمدی با آن سازمان را قویاً تکذیب کرد. گروهی از دانشجویان دانشکده فیزیک دانشگاه تهران هم، با انتشار بیانیه‌ای ضمن اشاره به جهت‌گیری‌های سیاسی اصلاح‌طلبانه‌ی دکتر علی‌محمدی، وی را فردی که «مشوق دانشجویان برای شرکت در راهپیمایی سکوت اعتراض‌آمیز به نتایج انتخابات بود»، معرفی کردند.