سازمان عفو بين‌الملل در گزارش ساليانه خود كه وضعيت حقوق بشر در كشورها را ارائه مى‌دهد، در بخش ايران به ويژه به رويدادهاى پس ازانتخابات و سركوب معترضان پرداخته است.
در اين گزارش تصريح شده كه سركوب معترضان به ويژه پس از دستور آيت لله خامنه‌اى، رهبر جمهورى اسلامى، در روز ۲۹ خرداد ۱۳۸۸ براى پايان دادن به اعتراض‌ها شدت گرفت.
كشته شدن ندا آقا سلطان مورد ديگرى است كه در اين گزارش به آن پرداخته شده است؛ عفو بين‌الملل تاكيد مى‌كند در حالى كه مشخص شد فرد ضارب ندا آقا سلطان عضوى از بسيج بوده ، مقام‌هاى جمهورى اسلامى، رسانه‌هاى بريتانيايى و آمريكايى را عامل قتل ندا سلطان معرفى كردند و خانواده وى و ديگران در مراسم عزادارى از سوى نيروهاى امنيتى مورد اذيت و آزار قرار گرفتند.
تبعيض عليه اقليت‌هاى دينى مورد ديگرى است كه در اين گزارش از آن ياد شده است.
در گزارش سازمان عفو بين الملل از ايران به عنوان كشورى كه داراى يكى از بالاترين ارقام اعدام است ياد شده است.