علی مطهری، نایبرییس مجلس شورای اسلامی در نامهای خطاب به مصطفی پورمحمدی، وزیر دادگستری در واکنش به اظهاراتش درباره اعدامهای سال ۶۷، او را به «پاسخ ندادن و توضیح واضحات» متهم کرد.
آقای مطهری پیشتر از وزیر دادگستری خواسته بود بعنوان نماینده وزارت اطلاعات توضیح دهد که نحوه اجرای حکم آیتالله خمینی درباره اعدامهای سال ۶۷ چگونه بوده است. مصطفی پورمحمدی همچنین در سال ۶۷ از اعضای هیاتی بود که به دستور آیتالله خمینی، رهبر وقت جمهوری اسلامی درباره اعدام زندانیان سیاسی و عقیدتی در تابستان ۶۷ تصمیم گرفتند.
او روز چهارم شهریور ماه در سحنانی در شورای اداری استان همدان از گروه مجاهدین خلق بعنوان دشمنان خونآشام ایران نام برد و گفت که بعضی بهدنبال تطهیر این گروه هستند. آقای پورمحمدی این سخنان را در واکنش به انتشار فایل صوتی آیتالله منتظری درباره اعدام زندانیان سیاسی در سال ۶۷ بیان کرد.