علی شمخانی، دبیر شورای امنمیت ملی ایران می‌گوید در صورت برگزاری همه‌پرسی استقلال در اقلیم کردستان عراق، توافقات امنیتی که تهران با حکومت اقلیم دارد، دیگر معتبر نخواهد بود.
علی شمخانی در گفت‌وگو با خبرگزاری صداو سیما در این باره افزود: جدایی اقلیم کردستان از عراق به معنای «پایان یافتن» تمام توافقهای نظامی و امنیتی دو طرفه و همچنین «مسدود شدن همه گذرگاه‌های مرزی» ایران با این اقلیم است.
علاوه بر ایران، دولت و پارلمان عراق، ترکیه و سوریه،آمریکا نیز خواستار لغو این همه پرسی شده است.
به رغم این مخالفت‌ها مقام‌های اقلیم کردستان عراق تأکید دارند که همه‌پرسی در تاریخ مقرّر، سوم مهرماه، برگزار خواهد شد.